Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SP140Q13342 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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SP140Q13342 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SP140Q13342 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SP140Q13342 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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SP140Q13342 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SP140Q13342 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SP140Q13342 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SP140Q13342 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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SP140Q13342 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP140Q13342 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP140Q13342 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP140Q13342 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP140Q13342 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP140Q13342 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP140Q13342 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP140Q13342 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP140Q13342 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP140Q13342 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP140Q13342 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP140Q13342 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP140Q13342 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SP140Q13342 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SP140Q13342 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SP140Q13342 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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