Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEMA3FQ13275 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.3 ms