Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NR1H3Q13133 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NR1H3Q13133 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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