Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
NFIAQ12857 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
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