Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
GTF3C1Q12789 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
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GTF3C1Q12789 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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GTF3C1Q12789 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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GTF3C1Q12789 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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GTF3C1Q12789 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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GTF3C1Q12789 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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GTF3C1Q12789 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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GTF3C1Q12789 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GTF3C1Q12789 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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