Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMP19Q99542 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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MMP19Q99542 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MMP19Q99542 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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