Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF548Q8NEK5 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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