Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NLRC3Q7RTR2 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NLRC3Q7RTR2 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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