Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRNQ16849 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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PTPRNQ16849 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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PTPRNQ16849 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRNQ16849 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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