Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC85BQ15834 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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