Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SF1Q15637 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SF1Q15637 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SF1Q15637 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SF1Q15637 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF1Q15637 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF1Q15637 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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