Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PUM3Q15397 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PUM3Q15397 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms