Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
POLD3Q15054 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
POLD3Q15054 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.8 ms