Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHPRHQ149N8 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
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SHPRHQ149N8 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
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SHPRHQ149N8 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
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SHPRHQ149N8 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
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SHPRHQ149N8 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
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SHPRHQ149N8 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
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SHPRHQ149N8 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHPRHQ149N8 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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