Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1CQ13936 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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