Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SF3B2Q13435 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF3B2Q13435 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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