Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEMA3FQ13275 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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