Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD11P31277 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD11P31277 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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