Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP9-2Q9BYQ4 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-2Q9BYQ4 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms