Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RBM42Q9BTD8 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms