Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

Predictions only

Length 5,635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMCN1Q96RW7 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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