Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
SMG1Q96Q15 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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