Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMX3Q96JJ7 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms