Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ANKRD39Q53RE8 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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