Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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