Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRNQ16849 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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PTPRNQ16849 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRNQ16849 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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