Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC6Q16204 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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