Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC85BQ15834 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC85BQ15834 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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