Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBA3CQ13748 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TUBA3CQ13748 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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