Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CUL3Q13618 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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