Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NAE1Q13564 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.3 ms