Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
HDAC1Q13547 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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