Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEMA3FQ13275 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.4 ms