Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNEQ04844 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms