Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMPD4Q9NXE4 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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