Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms