Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP53Q70EK8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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USP53Q70EK8 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP53Q70EK8 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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