Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ANKRD39Q53RE8 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms