Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.4 ms