Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC6Q16204 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC6Q16204 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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