Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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HERC1Q15751 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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HERC1Q15751 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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HERC1Q15751 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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HERC1Q15751 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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