Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SIX1Q15475 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SIX1Q15475 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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