Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERC3Q15034 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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