Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms