Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CAPSQ13938 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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