Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CUL3Q13618 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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