Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMAD4Q13485 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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