Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SF3B2Q13435 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SF3B2Q13435 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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