Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3FQ13275 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3FQ13275 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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