Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CSTF3Q12996 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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